Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NACAE9PAV3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms