Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L21D6R901 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP17L21D6R901 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
USP17L21D6R901 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP17L21D6R901 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L21D6R901 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP17L21D6R901 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP17L21D6R901 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP17L21D6R901 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L21D6R901 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L21D6R901 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L21D6R901 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L21D6R901 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L21D6R901 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L21D6R901 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L21D6R901 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L21D6R901 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L21D6R901 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L21D6R901 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms