Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF879B4DU55 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF879B4DU55 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms