Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM114B3SHH9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM114B3SHH9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms