Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HIGD1CA8MV81 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIGD1CA8MV81 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIGD1CA8MV81 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIGD1CA8MV81 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIGD1CA8MV81 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIGD1CA8MV81 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIGD1CA8MV81 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIGD1CA8MV81 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIGD1CA8MV81 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIGD1CA8MV81 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIGD1CA8MV81 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIGD1CA8MV81 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIGD1CA8MV81 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIGD1CA8MV81 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HIGD1CA8MV81 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms