Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.1 ms