Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PP2D1A8MPX8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PP2D1A8MPX8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms