Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COLCA2A8K830 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COLCA2A8K830 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms