Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACOD1A6NK06 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACOD1A6NK06 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms