Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC10BA6NIK2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC10BA6NIK2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms