Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HELTA6NFD8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms