Protein–RNA interactions for Protein: A6NCK2

TRIM43B, Tripartite motif-containing protein 43B, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43BA6NCK2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM43BA6NCK2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM43BA6NCK2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM43BA6NCK2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms