Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms