Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNOT1A5YKK6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT1A5YKK6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT1A5YKK6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms