Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
TRAPPC13A5PLN9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRAPPC13A5PLN9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms