Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRAMEF22A3QJZ6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRAMEF22A3QJZ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRAMEF22A3QJZ6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms