Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC66A2RUB6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC66A2RUB6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC66A2RUB6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms