Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0J9YYE9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0J9YYE9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0J9YYE9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0J9YYE9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0J9YYE9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0J9YYE9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0J9YYE9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0J9YYE9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0J9YYE9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0J9YYE9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0J9YYE9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0J9YYE9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0J9YYE9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.7 ms