Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A087X1B8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087X1B8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms