Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDY1Q9Y6F8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms