Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAF6Q9Y4K3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAF6Q9Y4K3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms