Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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