Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UTP11Q9Y3A2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms