Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SLC27A6Q9Y2P4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.2 ms