Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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FOXD3Q9UJU5 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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FOXD3Q9UJU5 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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FOXD3Q9UJU5 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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FOXD3Q9UJU5 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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FOXD3Q9UJU5 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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FOXD3Q9UJU5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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FOXD3Q9UJU5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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FOXD3Q9UJU5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXD3Q9UJU5 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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