Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms