Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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HDAC6Q9UBN7 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HDAC6Q9UBN7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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