Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CNTN3Q9P232 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CNTN3Q9P232 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CNTN3Q9P232 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CNTN3Q9P232 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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CNTN3Q9P232 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CNTN3Q9P232 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CNTN3Q9P232 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CNTN3Q9P232 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN3Q9P232 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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