Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFNKQ9P0W0 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms