Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CENPMQ9NSP4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms