Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TMPRSS4Q9NRS4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMPRSS4Q9NRS4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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