Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms