Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms