Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NLRP1Q9C000 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms