Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZV1

UBXN6, UBX domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6Q9BZV1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBXN6Q9BZV1 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms