Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 RDH10-203ENST00000519380 978 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRIX1P1-201ENST00000521785 908 ntBASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACTG1P22-202ENST00000605503 859 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355306.2-203ENST00000635102 1025 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC7□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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KRTAP9-3Q9BYQ3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIAS-201ENST00000261434 1258 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01066-201ENST00000415283 399 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001171.1-201ENST00000436373 864 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012558.1-201ENST00000451946 622 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC116366.2-201ENST00000454380 767 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00635-207ENST00000488852 1197 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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