Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCGF6Q9BYE7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCGF6Q9BYE7 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms