Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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