Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRIP1Q9BX63 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms