Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms