Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KATNB1Q9BVA0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms