Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FYCO1Q9BQS8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms