Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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PKP4Q99569 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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PKP4Q99569 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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PKP4Q99569 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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PKP4Q99569 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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PKP4Q99569 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PKP4Q99569 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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