Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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