Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIRT1Q96EB6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms