Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGDCC3Q8IVU1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms