Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC84Q86UT8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms