Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRCQ7RTU9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRCQ7RTU9 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRCQ7RTU9 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
STRCQ7RTU9 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRCQ7RTU9 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRCQ7RTU9 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRCQ7RTU9 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRCQ7RTU9 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms