Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC149Q6ZUS6 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms