Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 ROBO4-208ENST00000533054 3071 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C16orf54Q6UWD8 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms