Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATL3Q6DD88 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms